Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
GGA3Q9NZ52 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
GGA3Q9NZ52 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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