Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
MKRN4PQ13434 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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MKRN4PQ13434 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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MKRN4PQ13434 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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MKRN4PQ13434 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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MKRN4PQ13434 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
MKRN4PQ13434 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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