Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
FOXD1Q16676 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
FOXD1Q16676 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
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