Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTPREP23469 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PTPREP23469 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPREP23469 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPREP23469 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PTPREP23469 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPREP23469 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPREP23469 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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