Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRHP20396 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRHP20396 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
TRHP20396 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRHP20396 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
TRHP20396 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
TRHP20396 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
TRHP20396 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRHP20396 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms