Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SOBPA7XYQ1 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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