Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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BRD3Q15059 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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BRD3Q15059 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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BRD3Q15059 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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BRD3Q15059 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
BRD3Q15059 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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BRD3Q15059 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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BRD3Q15059 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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BRD3Q15059 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
BRD3Q15059 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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