Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NCOA4Q13772 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms