Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PKD2Q13563 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PKD2Q13563 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms