Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
TCIRG1Q13488 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TCIRG1Q13488 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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