Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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HCN4Q9Y3Q4 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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HCN4Q9Y3Q4 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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HCN4Q9Y3Q4 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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HCN4Q9Y3Q4 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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HCN4Q9Y3Q4 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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HCN4Q9Y3Q4 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
HCN4Q9Y3Q4 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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