Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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RAB39AQ14964 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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RAB39AQ14964 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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RAB39AQ14964 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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RAB39AQ14964 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RAB39AQ14964 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RAB39AQ14964 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
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