Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IRX1P78414 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IRX1P78414 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IRX1P78414 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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