Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 CNTNAP2-203ENST00000463592 6076 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD11P31277 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD11P31277 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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