Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRAP18433 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms