Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
J3KRW8 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
J3KRW8 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
J3KRW8 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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