Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CYLDQ9NQC7 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms