Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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KNOP1Q1ED39 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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KNOP1Q1ED39 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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KNOP1Q1ED39 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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KNOP1Q1ED39 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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KNOP1Q1ED39 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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KNOP1Q1ED39 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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