Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
USF2Q15853 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
USF2Q15853 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
USF2Q15853 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
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