Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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