Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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COL19A1Q14993 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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COL19A1Q14993 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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COL19A1Q14993 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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COL19A1Q14993 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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COL19A1Q14993 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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COL19A1Q14993 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL19A1Q14993 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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