Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKP1Q13835 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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