Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN3Q13064 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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