Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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