Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHAC2Q9Y5I4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms