Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2J1Q9Y385 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms