Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPSEQ9Y251 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms