Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC3Q9UQE7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC3Q9UQE7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms