Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNRC6BQ9UPQ9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNRC6BQ9UPQ9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms