Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCAF8Q9UPN6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCAF8Q9UPN6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms