Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB23Q9ULC3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms