Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MRTO4Q9UKD2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms