Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCN11AQ9UI33 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN11AQ9UI33 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms