Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP25Q9UHP3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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