Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HMGXB4Q9UGU5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HMGXB4Q9UGU5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms