Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGAT4CQ9UBM8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGAT4CQ9UBM8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms