Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL13Q9P2N7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms