Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL42Q9P2K6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms