Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHPF2Q9P2E5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms