Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
SCHIP1Q9P0W5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCHIP1Q9P0W5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms