Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NKIRAS2Q9NYR9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms