Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMOD3Q9NYL9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMOD3Q9NYL9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms