Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXC10Q9NYD6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXC10Q9NYD6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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