Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms