Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DUOX1Q9NRD9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms