Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NRIP3Q9NQ35 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRIP3Q9NQ35 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms