Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB9BQ9NP90 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms