Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEBOXQ9HB31 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEBOXQ9HB31 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms