Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NBPF3Q9H094 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBPF3Q9H094 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms