Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTDSP1Q9GZU7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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